Articles de journaux

 Villa-Vialaneix N., Liaubet L., Laurent T., Cherel P., Gamot A., SanCristobal M. (2013) The structure of a gene co-expression network reveals biological functions underlying eQTLs. PlOS ONE., 8(4), e60045.
Lien éditeur

 Villa-Vialaneix N., Jouve B., Rossi F., Hautefeuille F. (2012) Spatial correlation in bipartite networks : the impact of the geographical distances on the relations in a corpus of medieval transactions Revue des Nouvelles Technologies de l’Information, SHS-1, 97-110.
Lien éditeur

 Viguerie N., Montastier E., Maoret J.J., Roussel B., Combes M., Valle C., Villa-Vialaneix N., Iacovoni J.S., Martinez J.A., Holst C., Astrup A., Vidal H., Clément K., Hager J., Saris W.H.M., Langin D. (2012) Determinants of human adipose tissue gene expression : impact of diet, sex, metabolic status and cis genetic regulation. PLoS Genetics, 8, e1002959.
Lien éditeur

 Rohart F., Paris, A., Laurent B., Canlet C., Molina J., Mercat M., Tribout T., Muller N., Iannuccelli N., Villa-Vialaneix N., Liaubet L., Milan D., San Cristobal M. (2012) Phenotypic prediction based on metabolomic data on the growing pig from three main European breeds. Journal of Animal Science, 90(12).
Lien éditeur

 Cottrell M., Olteanu M., Rossi F., Rynkiewicz J., Villa-Vialaneix N. (2012) Neural networks for complex data. Künstliche Intelligenz, 26(2), 1-8.
Lien éditeur

 Villa-Vialaneix N., Follador M., Ratto M., Leip A. (2012) A comparison of eight metamodeling techniques for the simulation of N2O fluxes and N leaching from corn crops. Environmental Modelling and Software, 34, 51-66.
Lien éditeur

 Rossi F., Villa-Vialaneix N. (2011) Représentation d’un grand réseau à partir d’une classification hiérarchique de ses sommets. Journal de la Société Française de Statistique, 152(3), 34-65.
Lien éditeur

 Laurent T., Villa-Vialaneix N. (2011) Using spatial indexes for labeled network analysis. Revue I3 (Interaction, Intelligence, Information), 11(1).
Lien éditeur

 Rossi F., Villa-Vialaneix N. (2011) Consistency of functional learning methods based on derivatives. Pattern Recognition Letters, 32(8), 1197-1209.
Lien éditeur

 Villa-Vialaneix N., Dkaki T., Gadat S., Inglebert J.M., Truong Q.D. (2011) Recherche et représentation de communautés dans un grand graphe : une approche combinée. Document Numérique, 14(1), 59-80.
Lien éditeur

 Hernandez N., Biscay R.J., Villa-Vialaneix N., Talavera I. (2011) A Simulation Study of Functional Density-Based Inverse Regression. Revista Investigacion Operacional, 32(2), 146-159.
Lien éditeur

 Rossi F., Villa-Vialaneix N. (2010) Optimizing an organized modularity measure for topographic graph clustering : a deterministic annealing approach. Neurocomputing, 73(7-9), 1142-1163.
Lien éditeur

 Boulet R., Jouve B., Rossi F., Villa N. (2008) Batch kernel SOM and related Laplacian methods for social network analysis Neurocomputing, 71(7-9), 1257-1273.
Lien éditeur
Article commenté sur le site web du Magazine Nature, Nature News.(*)

 Ruiz-Gazen A., Villa N. (2007) Storms prediction : Logistic regression vs random forest for unbalanced data. Case Studies in Business, Industry and Government Statistics, 1(2), 91-101.

 Villa N., Paegelew M., Camacho Olmedo M.T., Cornez L., Ferraty F., Ferré L., Sarda P. (2007) Various approaches for predicting land cover in mountain areas. Communications in Statistics - Simulation and Computation, 36(1), 73-86. (Preprint avec les cartes en couleurs.)
Lien éditeur

 Ferré L., Villa N. (2006) Multi-Layer perceptron with functional inputs : an inverse regression approach. Scandinavian Journal of Statistics, 33(4), 807-823.

 Villa N., Rossi, F. (2006) Un résultat de consistance pour des SVM fonctionnels par interpolation spline. Comptes Rendus de l’Académie des Sciences, Série I (Mathématiques), 343(8), 555-560.
Lien éditeur

 Rossi F., Villa N. (2006) Support Vector Machine for Functional Data Classification. Neurocomputing, 69(7-9), 730-742.

 Ferré L., Villa N. (2005) Discrimination de courbes par régression inverse fonctionnelle. Revue de Statistique Appliquée, LIII(1), 39-57.

 Paegelow M., Villa N., Cornez L., Ferraty F., Ferré L., Sarda P. (2004) Modélisations prospectives de l’occupation du sol. Le cas d’une montagne méditerranéenne (Prospective modelling of land cover in mediterranean moutain areas). Cybergéo, 295, 6/12/04.

Éditoriaux

 Cottrell M., Olteanu M., Rouchier J., Villa-Vialaneix N. (2012 Éditorial du numéro spécial RNTI - MASHS 2011/2012 : Modèles et Apprentissage en Sciences Humaines et Sociales, Revue des Nouvelles Technologies de l’Information, SHS-1, 97-110.
Lien éditeur

 Villa-Vialaneix N., Liaubet L., SanCristobal M. (2011) What is a good (gene) network ? Journal of Animal Breeding and Genetics, 128(1), 1-2.
Lien éditeur

Chapitres d’ouvrages collectifs

 Paegelow M., Camacho-Olmedo M.T., Ferraty F., Ferré L., Sarda P., Villa N. (2008) Prospective modelling of environmental dynamics. A methodological comparison applied to mountain land cover changes. In Modelling Environmental Dynamics, Paegelow & Camacho Olmedo Eds., Springer.

 Follador M., Villa N., Paegelow M., Renno F., Bruno R. (2008) Tropical deforestation modelling : a comparative analysis of different predictive approaches. The case study of Peten, Guatemala. In Modelling Environmental Dynamics, Paegelow & Camacho Olmedo Eds., Springer.

Conférences internationales avec comité de lecture et publication des actes

 Massoni S., Olteanu M., Villa-Vialaneix N. (2013) Which distance use when extracting typologies in sequence analysis ? An application to school to work transitions. In Proceedings of IWANN 2013, Tenerife, Puerto de la Cruz, 12-14 June. À paraître

 Olteanu M., Villa-Vialaneix N., Cierco-Ayrolles C. (2013) Multiple kernel self-organizing maps. In Proceedings of ESANN 2013, Bruges, Belgique, 24-26 avril, 83-88.
Présentation

 Olteanu M., Villa-Vialaneix N., Cottrell M. (2012) On-line relational SOM for dissimilarity data In Advances in Self-Organizing Maps (Proceedings of WSOM 2012, Santiago, Chili, 12-14 décembre 2012), Estevez P., Principe J., Zegers P., Barreto G. (eds.), ’Advances in Intelligent Systems and Computing’ series,http://iwann.ugr.es/2013/iwann13.php Springer Verlag, Berlin, Heidelberg, 2012, 198, 13-22.
Best paper award of the conference
Lien éditeur

 Hernandez N., Biscay R.J., Villa-Vialaneix N., Talavera-Bustamante I. (2010) A functional density-based nonparametric approach for statistical calibration. In Progress in Pattern Recognition, Image Analysis, Computer Vision, and Applications - 15th Iberoamerican Congress on Pattern Recognition, CIARP 2010, Sao Paulo, Brésil, 8-11 Novembre. Lecture Notes in Computer Science, 6419, Springer 2010, 450-457.
Lien éditeur

 Rohart F., Villa-Vialaneix N., Paris A., Canlet C., Molina J., Milan D., Laurent B., SanCristobal M. (2010) Phenotypic prediction based on metabolomic data : lasso vs Bolasso, primary data vs wavelet data. In Proceedings of WCGALP 2010, Leipzig, Allemagne, 1-6 Août.

 Liaubet L., Villa-Vialaneix N., Gamot A., Rossi F., Chérel P., SanCristobal M. (2010) The structure of a gene network reveals 7 biological functions underlying eQTLs in pig. In Proceedings of WCGALP 2010, Leipzig, Allemagne, 1-6 Août.

 Villa-Vialaneix N., Follador M., Leip A. (2010) A comparison of three learning methods to predict N2O fluxes and N leaching. In Proceedings of MASHS 2010, Lille, France, 10-11 Juin, p 57-64 (Bienacki C., Masson, E., Lendasse, A. and Séverin, E. eds).
Présentation

 Rossi F., Villa N. (2009) Topologically ordered graph clustering via deterministic annealing. In proceedings of ESANN 2009, Bruges, Belgique. 529-534, Avril 2009.

 Villa N., Rossi F. (2008) Recent advances in the use of SVM for functional data classification. In proceedings of IWFOS 2008 Toulouse, France, 5/7 Juin 2008.
Paru dans Functional and Operatorial Statistics, Ferraty, F. and Dabo-Niang S. Eds, Contributions to Statistics series, Springer, p 273-280.

 Rossi F., Villa N. (2008) Consistency of derivative based functional classifiers on sampled data. In proceedings of ESANN 2008, Bruges, Belgique, 445-450.

 Villa N., Rossi F. (2007) A comparison between dissimilarity SOM and kernel SOM for clustering the vertices of a graph. In proceedings of WSOM 2007, Bielefeld, Allemagne, 3/6 Septembre 2007.
Best paper award of the conference
Présentation : Diaporama.

 Villa N., Boulet R. (2007) Clustering a medieval social network by SOM using a kernel based distance measure. In Proceedings of ESANN 2007, Bruges, Belgique, 31-36.
Présentation : Diaporama.

 Bruno R., Follador M., Paegelow M., Renno F., Villa N. (2006) Integrating Remote Sensing, GIS and Prediction Models to Monitor the Deforestation and Erosion in Peten Reserve, Guatemala. In proceedings of XIth International Congress for Mathematical Geology, IAMG 2006, Liège, Belgique, Septembre 2006.

 Rossi F., Villa N. (2005) Classification in Hilbert Spaces with Support Vector Machines. In proceedings of ASMDA 2005, Brest, France, 635-642.

 Villa N., Rossi F. (2005) Support Vector Machine for Functional Data Classification. In Proceedings of ESANN 2005, Bruges, Belgique, 467-472.

Conférences invitées

 Rossi F., Villa-Vialaneix N., Hautefeuille F. (2011) Exploration of a large database of French notarial acts with social network methods. Digital Diplomatics 2011, Naples, Italie, 29 Septembre - 1er Octobre 2011.
Résumé et Poster (format A0).

 Rossi F., Villa-Vialaneix N., Hautefeuille F. (2011) Exploration of a large database of French charters with social network methods. International Medieval Congress (IMC 2011), Session 1607 « Problems and Possibilities of Early Medieval Diplomatic, II : Members and Margins », Leeds, Royaume-Unis, 11-14 Juillet 2011.
Résumé : Although charters are often considered to be ruled by formulae, their evidential value sometimes lies in the ways in which they deviate from norms, whether this be in what they record or how they are recorded. In this session in-groups and out-groups are considered at several levels : Hofmann asks when and why women featured in Carolingian-era charters ; Hodge asks whether transaction documents recorded in unconventional contexts can be grouped with more conventional charters ; and Rossi describes new computerised approaches that may allow us to depict in-groups and out-groups in social networks in hitherto-impossible clarity, the third paper has been co-authored with Florent Hautefeuille (Université de Toulouse II - Le Mirail) and Nathalie Villa (Université de Toulouse III - Paul Sabatier / Université de Perpignan - Via Domitia).

 Villa-Vialaneix N., Rossi F. (2010) Classification and regression based on derivatives : a consistency result. II Simposio sobre Modelamiento Estadístico, Valparaiso, Chile, 2-3 Novembre 2010.
Présentation : Diaporama and Version imprimable.

 Villa N., Rossi F. (2009) Méthode de classification organisée pour les recherche de communautés dans les réseaux sociaux. Dans Actes des 41èmes Journées de Statistique, SFdS, Journée satellite STID, Bordeaux, France, 29 mai 2009.
Archive HAL
Présentation : Diaporama

 Villa N., Rossi F., Truong Q.D. (2008) Mining a medieval social network by kernel SOM and related methods. In proceedings of MASHS 2008 (Modèles et Apprentissages en Sciences Humaines et Sociales), Créteil, France, 5/6 Juin 2008.
Présentation : Diaporama à accompagner des Figures dates et lieux.
Article commenté sur The physics arXiv Blog.

Autres conférences

 Villa-Vialaneix N., San Cristobal M. (2013) Consensus LASSO : inférence conjointe de réseaux de gènes dans des conditions expérimentales multiples. Dans Actes des : 45e Journées de Statistique, Toulouse, France, May, 27-31. À paraître

 Villa-Vialaneix N., Olteanu M., Cierco-Ayrolles C. (2013) Carte auto-organisatrice pour graphes étiquetés. In Ateliers Fouille de Grands Graphes, Extraction et Gestion des Connaissances (EGC), Toulouse, France, 29 Janvier.
Présentation

 Villa-Vialaneix N., Edwards N.A., Liaubet L., Viguerie N., SanCristobal M. (2012) Comparison of network inference packages and methods for multiple network inference. In 1ères Rencontres R, Bordeaux, France, 2/3 juillet.
Présentation

 Villa-Vialaneix N., Rossi F., Hautefeuille F. (2012) Exploration relationnelle d’un corpus d’actes notariés médiévaux. In Colloque Configuration(s), Paris, France, 8/9 juin.

 Villa-Vialaneix N., Jouve B., Rossi F., Hautefeuille F. (2012) Spatial correlation in bipartite networks : the impact of the geographical distances on the relations in a corpus of medieval transactions. In MASHS 2012 (Modèles et Apprentissage en Sciences Humaines et Sociales), Paris, France, 4/5 juin.
Présentation

 Laurent T.., Villa-Vialaneix N. (2012) Analyse de données pour des graphes étiquetés. In Actes des 44èmes Journées de Statistique, Société Française de Statistique, Bruxelles, Belgique, 21/25 mai.
Présentation

 Leip A., Follador M., Tarantola S., Busto M., Villa-Vialaneix N. (2011) Sensitivity of the process-based model DNDC on microbiological parameters. In Nitrogen and Global Change - Key findings & Future challenges, Edinburgh, Royaume-Unis, 11-14 avril.
lien éditeur poster

 Nathalie Villa-Vialaneix, Laurence Liaubet, Thibault Laurent, Adrien Gamot, Pierre Cherel & Magali Sancristobal (2011) L’analyse d’un reseau de co-expression génique met en valeur des groupes fonctionnels homogènes et des gènes importants relatifs a un phénotype d’intérêt. Actes des 43èmes Journées de Statistique, Société Française de Statistique, Tunis, Tunisie, 23-27 Mai.
Présentation

 Thibault Laurent & Nathalie Villa-Vialaneix (2010) Analysis of the influence of a network on the values of its nodes : the use of spatial indexes. In MARAMI 2010, Toulouse, France, 11-12 Octobre, 2010.
Présentation

 Adrien Gamot, Nathalie Villa, Laurence Liaubet, Fabrice Rossi, Gwenola Tosser-Kopp, Pierre Chérel & Magali SanCristobal (2009) Are gene networks always meaningful ? Short communication in EADGENE Days 2009, Paris, France, 13-15 Octobre 2009.
Résumé et Présentation (par Magali SanCristobal)

 Nathalie Villa, Taoufiq Dkaki, Sébastien Gadat, Jean-Michel Inglebert & Quoc-Dinh Truong (2009) Recherche et représentation de communautés dans des grands graphes. In Proceedings of VSST 2009, Nancy, France, 30/31 mars 2009.

 Romain Boulet, Florent Hautefeuille, Bertrand Jouve, Pascale Kuntz, Bleuenn Le Goffic, Fabien Picarougne & Nathalie Villa (2007) Sur l’analyse de réseaux de sociabilité dans la société paysanne médiévale. Actes des journées MASHS 2007, Brest, France, 10-11 Mai 2007.

 Marco Follador, Fernanda Renno, Roberto Bruno, Martin Paëgelow, Nathalie Villa & Jean-François Mas (2007) Remote sensing, GIS and predictive methods : a new approach to environmental and hazard problems. Poster dans GeoItalia 2007, Rimini, Italie, 12/14 Septembre 2007.

 Nathalie Villa & Fabrice Rossi (2006) SVM fonctionnels par interpolation spline. Actes des 38° Journées de Statistique, Clamart, France, Mai/Juin 2006.
Présentation : Diaporama ou Transparents .

Co-auteurs

Liste de mes co-auteurs (par ordre alphabètique) : Rolando J. Biscay, Romain Boulet, Roberto Bruno, Mirko Busto, Maria-Teresa Camacho-Olmedo, Pierre Cherel, Christine Cierco-Ayrolles, Laurence Cornez, Marie Cottrell, Taoufiq Dkaki, Nicolas Edwards, Frédéric Ferraty, Louis Ferré, Marco Follador, Sébastien Gadat, Adrien Gamot, Noslen Hernandez, Jean-Michel Inglebert, Bertrand Jouve, Pascale Kuntz, Bleuenn Le Goffic, Florent Hautefeuille, Béatrice Laurent, Thibault Laurent, Adrian Leip, Laurence Liaubet, Madalina Olteanu, Martin Paegelow, Alain Paris, Fabien Picarougne, Marco Ratto, Fernanda Renno, Florian Rohart, Fabrice Rossi, Anne Ruiz-Gazen, Joseph Rynkiewicz, Magali SanCristobal, Pascal Sarda, Isneri Talavera-Bustamente, Stefano Tarantola, Gwenola Tosser-Klopp, Quoc-Dinh Truong, Nathalie Viguerie.